Döngüler için R içinde değerler listesindeki öğeleri tanıma

Question

Bir işlev çağrısında Değerler listemdeki (RStudio'da) öğeleri tanımak için R alma konusunda bir sorun yaşıyorum (sadece genel bir işlev olarak burada belirtin). İşte bir örnek ... gayet aşağıdaki eserlerini doğrudan bunu yazarsanız:

result <- function(cnv.chr1.S1, cnv.chr1.S2, cnv.chr1.S3) 

cnv.chr1.S1, cnv.chr1.S2 ve cnv.chr1.S3 nesneler (özellikle nesneleri GRANGES çünkü) Daha önce oluşturduğum.

Ama farklı kromozomlar üzerinde döngü ediyorum ve gerçekten birçok 3'ten fazla örnekleri (S1, S2, S3) olduğu gibi, ben Ancak bunu izleyen (burada basitleştirilmiş)

chrom <- paste("chr", 1:1, sep = "") 
sample.names <- paste("S", 1:3, sep = "") 
for (thischrom in chrom) 
{ 
    for (sample in sample.names) 
    { 
    a <- function(list(paste(paste("cnv", thischrom, sep = "."), sample.names, sep = "."))) 
    } 
} 

denedim

, Değerlerim listesindeki öğelerle aynı ada sahip öğelerin bir karakter listesini oluşturduğu için çalışmaz. Değerler listemdeki uygun nesnelere R'yi nasıl alabilirim?

Sahip olabileceğiniz tüm düşünceler için teşekkürler!

Steve

Answer 1

Böyle bir şey mi arıyorsunuz?

library(dplyr) 

chrom <- paste("chr", 1:1, sep = "") 
sample.names <- paste("S", 1:2, sep = "") 

cnv.chr1.S1 = c(1, 2) 
cnv.chr1.S2 = c(2, 3) 

result = 
    data_frame(chrom = chrom) %>% 
    merge(data_frame(sample.names = sample.names)) %>% 
    rowwise %>% 
    mutate(object = 
      paste("cnv", chrom, sample.names, sep = ".") %>% 
      parse(text = .) %>% 
      eval %>% 
      list)