2012-02-17 22 views
11

Üçlü iç içe geçmiş bir döngüyü hızlandırmak için Python'un itertools modülünü kullanmaya çalışıyorum.Python itertools - yavaş mı?

İçiçe döngü süresi = 2,35023 saniye

Itertools döngü süresi = 2,67766 saniye

bir şey eksik: Aşağıdaki test kodu itertools' ürün yöntemi ve çıkışlar ile standart bir üçlü iç içe döngü karşılaştırır?

import numpy 
import itertools 
import time 

n = 128 
a = numpy.arange(n**3).reshape((n,n,n)) 
b = numpy.zeros((n,n,n)) 
c = numpy.zeros((n,n,n)) 

t = time.time() 
for i in range(n): 
    for j in range(n): 
     for k in range(n): 
      b[i,j,k] = a[i,j,k] 
print 'Nested loop time = %g secs' % (time.time() - t) 

t = time.time() 
for (i,j,k) in itertools.product(range(n), repeat=3): 
    c[i,j,k] = a[i,j,k] 
print 'Itertools loop time = %g secs' % (time.time() - t) 
O itertools.product gibi görünüyor
+0

"Bir şey özlüyor muyum?" - Kaybettiğiniz şey, hiç kimsenin "itertools.product()") fikrinin, döngüler için –

+3

@Sven Marnach 9.7 'yi iç içe hızlandırmak olduğunu iddia etmemesidir. itertools - Etkin döngü için yineleyiciler oluşturma işlevleri ... http: //docs.python.org/library/itertools.html –

cevap

9

büyük n değerleri için yavaştır: eğlence için de

 
In [40]: print _39 
from itertools import product 

def itertools_product(n): 
    for ijk in product(range(n), repeat=3): 
     pass 

In [41]: %timeit itertools_product(128) 
10 loops, best of 3: 115 ms per loop 

In [42]: %timeit itertools_product(10) 
10000 loops, best of 3: 59.2 us per loop 

In [43]: %timeit itertools_product(300) 
1 loops, best of 3: 1.47 s per loop 

, liste comprehensions ve jeneratör ifadeleri:

 
In [24]: print _23 
from itertools import product 

def nested_loops(n): 
    for i in range(n): 
     for j in range(n): 
      for k in range(n): 
       pass 

def itertools_product(n): 
    for (i,j,k) in product(range(n), repeat=3): 
     pass 


In [25]: %timeit nested_loops(128) 
10 loops, best of 3: 68.6 ms per loop 

In [26]: %timeit itertools_product(128) 
10 loops, best of 3: 162 ms per loop 

In [27]: %timeit nested_loops(10) 
10000 loops, best of 3: 84.5 us per loop 

In [28]: %timeit itertools_product(10) 
10000 loops, best of 3: 79.8 us per loop 

In [30]: %timeit nested_loops(300) 
1 loops, best of 3: 833 ms per loop 

In [31]: %timeit itertools_product(300) 
1 loops, best of 3: 2.07 s per loop 

Ve tanımlama grubu veri açma olmadan :

 
def list_comprehension_product(n): 
    range_n = range(n) 
    for (i,j,k) in [ (i, j, k) for i in range_n for j in range_n for k in range_n ]: 
     pass 

def generator_expression_product(n): 
    range_n = range(n) 
    for (i,j,k) in ((i, j, k) for i in range_n for j in range_n for k in range_n): 
     pass 

In [51]: %timeit list_comprehension_product(128) 
1 loops, best of 3: 583 ms per loop 

In [52]: %timeit generator_expression_product(128) 
1 loops, best of 3: 480 ms per loop 

Bu kriterler python --version ile yürütülmüştür: İkinci döngü belki de tanımlama grubu veri açma birinci, daha yavaş olduğunu görünüyor

2.6.7 (r267:88850, Jul 31 2011, 19:30:54) 
[GCC 4.2.1 (Based on Apple Inc. build 5658) (LLVM build 2335.15.00)]
+1

Evet, büyük aralıklar için daha yavaş görünüyor. Ve tam olarak istediğiniz yerde daha hızlı - değil mi? – repoman

5

. Bunu yapmak zorunda değilsin ve bunu böyle yapmak üzere ikinci döngü daha hızlı yapar bulmak:

Tabii
for ijk in itertools.product(range(n), repeat=3): 
    c[ijk] = a[ijk] 

, Numpy ile, kullanmak yerine hiç unsurları üzerinde döngü önlemek ve istediğiniz tüm dizide aynı anda numpy işlemleri. Bu şekilde, tüm döngü, vb, C yapılır ve büyük hızlandırır elde edersiniz.

+0

Bunun ilgili olduğunu yazmayı istemedim. Hızlı üçlü indekslemeye izin verecek bir şeye sahip olmak için sadece numpy kullanılır. Üçlü bir argümanla bazı işlevler için bir çağrı olabilirdi ... – repoman