Pekala, süper bilgisayarımızdaki tek bir iş olarak maskelenen seri MPI işlerini çalıştırmaya çalışıyorum. Ana gönderme komut temelde benziyor: gibi"/ bin/bash -l" Geçersiz seçenek
#!/bin/bash -l
#PBS -l nodes=4:ppn=8,walltime=24:00:00
cat $PBS_NODEFILE | uniq | tr '\\012' ' ' > tmp-$PBS_JOBID
read -a NODE < tmp-$PBS_JOBID
rm tmp-$PBS_JOBID
inode=-1
ijob=0
for ((K=1;K<=8;K++))
do
[ $((ijob++ % 2)) -eq 0 ] && ((inode++))
ssh ${NODE[inode]} _somepath_/RUN$K/sub.script &
done
wait
exit 0
Her sub.script görünür: Her sub.script için bir hatayla karşılaşabilir
#!/bin/bash -l
#PBS -l walltime=24:00:00,nodes=1:ppn=4
module load intel
module load ompi
export FORT_BUFFERED=1
*run executable*
wait
exit 0
Ve bazen (işler hemen die):
/bin/bash: -
: invalid option
Usage: /bin/bash [GNU long option] [option] ...
/bin/bash [GNU long option] [option] script-file ...
*etc.*
En ilginç şey, ikinci (veya 3. vb.) Zaman için aynı komut dosyasını çalıştırırsam, herhangi bir sorun olmadan çalışacağı anlamına gelir. Bazen şanslıyım, bazen değil ... Çıkarma -l yardımcı olmaz çünkü bu durumda modüller yüklenemez ve mpirun işe yaramaz. Herhangi bir öneri nasıl düzeltilir?
Çok önceden teşekkürler!
Oh, çok teşekkürler! Onlar gerçekten DOS formatındaydı. Ama benim için bazen garip, bazen işe yaramazlardı. Ne olursa olsun ... – Eofet
'apt-get update' ' apt-get install tofrodos ' 'fromdos dosya.sh' veya ' todos arşivi.sh' –