Fortran uzantısı, Python'dan f2py'ye: Nasıl profillenir?

Question

F2py (Ver. 2) ile derlenen Fortran (gfortran 4.4.7) 'da yazılan Python (2.7.2) uzantısını kullanıyorum.

Python parçasını cProfile ile profilleyebilirim, ancak sonuç Fortran işlevleri hakkında bilgi vermiyor. Bunun yerine, zaman Fortran işlevini çağıran Python işlevine atfedilir.

... f2py --opt="-pg -O" almak konusunda herhangi bir ipucu:

ben yanı sıra aracılığıyla paylaşılan nesne oluştururken f2py çağrısında inşa tüm Fortran nesneler için "dekarboksi -O" bayrakları sağladı Fortran bilgi de çok takdir edilmektedir.

Başka bir profiler ile benzer bir kurulum kullanan biri varsa, ben de ilgilenirim.

Answer 1

Bir Fortran işlev çağrısı gibi görünür:

<ipython-input-51-f4bf36c6a947>:84(<module>). 

Biliyorum, çağrılan hangi modül tespit edemez ama en azından bu size bir fikir verir.

Başka bir yol onu bir Python işlevine sarar ve daha sonra Python işlevinin zamanlamasını görür.

Answer 2

Python uzantı profilleyicisi yep'a bakın.

Answer 3

Bu iş akışı oldukça iyi iş gibi görünüyor: :

• 1. Kullanım callgrind kodunuzun profilini (bu callgrind.out.27237 gibi bir dosya oluşturur)

     valgrind --tool = callgrind python my_python_script_calling_f2py_functions.py arg1 arg2

     • 2. .dot dosyasının (gerekirse, sizinle gprof2dot yükleyebilirsiniz: "git + https://github.com/jrfonseca/gprof2dot yüklemek pip") dönüştürme

     gprof2dot -f callgrind callgrind.out.27237> callgrind.dot

     • 3. graphviz bir grafik (bu stackoverflow soru Interpreting callgrind data bakınız) oluşturun:

     nokta -Tjpg callgrind.dot -o callgrind.jpg