R fonksiyonu

Question

Ben komut satırından R komut dosyalarını çalıştırabilirsiniz böylece, komut satırı argümanları ayrıştırmak için kullanıyorum aşağıda aşağıdaki işlevi vardır: İşte

parseArguments <- function() { 
    text1 <- commandArgs(TRUE) 
    eval(parse(text=gsub("\\s", ";", gsub("--","", text1)))) 
    args <- list() 
    for(ar in ls()[! ls() %in% c("text1", "args")]) {args[ar] <- get(ar)} 
    return (args) 
} 

bir CLI olduğunu

./myscript.R --param1='XLIF' --param2='ESX' --param3=5650.0 --param4=5499.2 --param5=0.0027397260274 --param6='Jul' --riskfreerate=0.817284313119 --datafile='/path/to/some/datafile.csv' --imagedir='/path/to/images' --param7=2012 --param8=2 
Error in parse(text = gsub("\\s", ";", gsub("--", "", text1))) : 
    8:10: unexpected '/' 
7: riskfreerate=0.817284313119 
8: datafile=/ 
      ^
Calls: parseArguments -> eval -> parse 
Execution halted 

Yardım: aşağıdaki komut satırı argümanları kullanarak, CL argümanları ayrıştırmak için yukarıdaki işlevini kullanan bir R senaryoyu aramaya teşebbüs seans çıktı?

[[Güncelleme]] Ben Dirk en tavsiyesine uyarak optparse kütüphane kurduktan

.

library(optparse) 

# Get the parameters 
option_list <- list(
    make_option(c("-m", "--param1"), action="store_false"), 
    make_option(c("-t", "--param2"), action="store_false"), 
    make_option(c("-a", "--param3"), action="store_false"), 
    make_option(c("-s", "--param4"), action="store_false"), 
    make_option(c("-x", "--param5"), action="store_false"), 
    make_option(c("-o", "--param6"), action="store_false"), 
    make_option(c("-y", "--param7"), action="store_false"), 
    make_option(c("-r", "--riskfreerate"), action="store_false"), 
    make_option(c("-c", "--param8"), action="store_false"), 
    make_option(c("-d", "--datafile"), action="store_false"), 
    make_option(c("-i", "--imagedir"), action="store_false") 
) 

# get command line options, i 
opt <- parse_args(OptionParser(option_list=option_list)) 

bunu aynı komut satırı parametreleri geçen R komut dosyasını çalıştırın, alıyorum:: My kod artık şöyle

Loading required package: methods 
Loading required package: getopt 
Error in getopt(spec = spec, opt = args) : 
    long flag "param1" accepts no arguments 
Calls: parse_args -> getopt 
Execution halted 

???

Answer 1

Eğer optparse ile karşılaşmak:

make_option yardım sayfasında (...) itibaren

:

eylemi: aksiyon optparse tanımlayan karakter dizesi bir seçenekle karşılaştığında, "mağaza", "store_true" veya "store_false" almalıdır. Varsayılan, komut dizesinde seçenek bulunursa, optparse'nin belirtilen aşağıdaki değeri depolaması gerektiğini belirten "depo" dır. Seçenek bulunduğunda "store_true", TRUE'yi saklar ve seçenek bulunduğunda "store_false", FALSE'ı saklar.

Kısacası

, size böyle bir şey çalıştırmak istiyorsanız action = "store" (varsayılan) kullanmak gerekir. bağlantıdan

./myscript.R --param1='XLIF' --param2='ESX' [...] 

Answer 2

Evet, bunun için sadece getopt ve optparse CRAN paketleri var. Ben hata hakkında, ikinci soruyu yanıtlarken