anova'da karşıtlıklar

Question

Önceki mesajların karşıtlıklarını anlıyorum ve bence doğru olanı yapıyorum ama ne beklediğimi vermiyor.

x <- c(11.80856, 11.89269, 11.42944, 12.03155, 10.40744, 
     12.48229, 12.1188, 11.76914, 0, 0, 
     13.65773, 13.83269, 13.2401, 14.54421, 13.40312) 
type <- factor(c(rep("g",5),rep("i",5),rep("t",5))) 
type 
[1] g g g g g i i i i i t t t t t 
Levels: g i t 

ı çalıştırdığınızda bu: "g" benim tipim, benim typei türü "g" arasındaki fark ve "i" yazın ve benim typet bu bağlantılarda

> summary.lm(aov(x ~ type)) 

Call: 
aov(formula = x ~ type) 

Residuals: 
    Min  1Q Median  3Q  Max 
-7.2740 -0.4140 0.0971 0.6631 5.2082 

Coefficients: 
      Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)  
(Intercept) 11.514  1.729 6.659 2.33e-05 *** 
typei   -4.240  2.445 -1.734 0.109  
typet   2.222  2.445 0.909 0.381  
--- 
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

Residual standard error: 3.866 on 12 degrees of freedom 
Multiple R-squared: 0.3753,  Adjusted R-squared: 0.2712 
F-statistic: 3.605 on 2 and 12 DF, p-value: 0.05943 

benim referans almaktadır

"g" tipi ile "t" tipi arasındaki fark.

ben "t"

yüzden

kontrastlar typei+typeg arasında burada iki tezat, fark görmek ve türü arasında "t" ve farkı "i" yazıp tip istedik

> contrasts(type) <- cbind(c(-1,-1,2),c(0,-1,1)) 
> summary.lm(aov(x~type)) 

Call: 
aov(formula = x ~ type) 

Residuals: 
    Min  1Q Median  3Q  Max 
-7.2740 -0.4140 0.0971 0.6631 5.2082 

Coefficients: 
      Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)  
(Intercept) 10.8412  0.9983 10.860 1.46e-07 *** 
type1  -0.6728  1.4118 -0.477 0.642  
type2   4.2399  2.4453 1.734 0.109  
--- 
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

Residual standard error: 3.866 on 12 degrees of freedom 
Multiple R-squared: 0.3753,  Adjusted R-squared: 0.2712 
F-statistic: 3.605 on 2 and 12 DF, p-value: 0.05943 

I referansımı değiştirerek ikinci kontrastı yapmaya çalışıyorum farklı sonuçlar elde ediyorum. Kontrastımın yanlış olanını anlamadım.

Answer 1

refence: İstatistiksel sorular için http://www.ats.ucla.edu/stat/r/library/contrast_coding.htm

mat <- cbind(rep(1/3, 3), "g+i vs t"=c(-1/2, -1/2, 1),"i vs t"=c(0, -1, 1)) 
mymat <- solve(t(mat)) 
my.contrast <- mymat[,2:3] 
contrasts(type) <- my.contrast 
summary.lm(aov(x ~ type)) 

my.contrast 
>  g+i vs t i vs t 
[1,] -1.3333  1 
[2,] 0.6667  -1 
[3,] 0.6667  0 
> contrasts(type) <- my.contrast 
> summary.lm(aov(x ~ type)) 

Call: 
aov(formula = x ~ type) 

Residuals: 
    Min  1Q Median  3Q Max 
-7.274 -0.414 0.097 0.663 5.208 

Coefficients: 
      Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)  
(Intercept) 10.841  0.998 10.86 1.5e-07 *** 
typeg+i vs t 4.342  2.118 2.05 0.063 . 
typei vs t  6.462  2.445 2.64 0.021 * 
--- 
Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1 

Residual standard error: 3.87 on 12 degrees of freedom 
Multiple R-squared: 0.375, Adjusted R-squared: 0.271 
F-statistic: 3.6 on 2 and 12 DF, p-value: 0.0594