Python: bir grafiğin renklenmesiyle numpy.asarray ile ilgili hata

Question

Tamamen bağlanamayan bir dizi grafikle ilgileniyorum, ör. Burada ve burada düğümlerin izole kümeleri olabilir.

Her düğümden geçen en kısa yol sayısına bağlı olarak, her bir düğüme cmap='jet''dan gelen bir renk vermek istiyorum.

Kod bloğu: grafik bağlı ve hiçbir kümeleri vardır edilir

#Given my fragmented graph F, count the shortest paths passing through each node: 
def num_spaths(F): 
      num_spaths = dict.fromkeys(F, 0.0) 
      spaths = nx.all_pairs_shortest_path(F) 
      for source in F: 
       for path in spaths[source].values(): 
        for node in path[1:]: 
         num_spaths[node] += 1 
      return num_spaths 

num_short_paths=num_spaths(F) #Calling the function on F 

my_shortest_paths = num_short_paths.values() #Getting the dict values 
nodes = F.nodes() #Storing the nodes in F 
#Determining the number of colors 
n_color = numpy.asarray([my_shortest_paths[n] for n in nodes]) 

, ben sorunumuz yok. Grafiğin kümeleri varsa, n_color, sürekli olmayan bir dizi olarak sonuçlanır, çünkü parçalanmış grafik bazı düğümleri (örneğin, 0'dan N'ye gidiyor, tüm düğümler nodes'da grafik parçalanmışsa mevcut değildir) kaybetti.

Bu, bir hata üretir: IndexError: list index out of rangen_color = numpy.asarray([my_shortest_paths[n] for n in nodes]) satırında işaret eder.

• Sigara parçalanmış grafik: nodes=[0,1,2,3...,N]
• Parçalanmış grafiği: nodes=[0,2,3,...,N]

Sorum: nasıl inşa edebilirsiniz benim n_color dikkate alarak

düğümler hakkında daha net olmak gerekirse grafiğimde bazı düğümler mevcut olmayabilir? Bence bu soru şu şekildedir: 'u, cmap ile birlikte kullanılmak üzere, ayrık fakat sürekli olmayan bir şekilde nasıl oluşturabilirim?

DÜZENLEME

Ben böylece bazı sınır oluşturarak, n_color=[0,5000,10000,15000,20000,25000,30000,35000,40000,45000,50000] ile çalıştı, ama sonra bu hatayı alıyorum: ValueError: Color array must be two-dimensional.

Answer 1

Sizin my_shortest_paths aslında bir liste ve my_shortest_paths[n] for n in nodes, sizin düğüm dizininizin adını dizininizi olarak kullanıyorsunuz, sorununuzu neden oldu.

Bunun yerine n_color = numpy.asarray([num_short_paths[n] for n in nodes])'u kullanabilirsiniz.