Python ile bir ikili dosyayı okuma

Question

Python ile özellikle zor okunan ikili dosyaları buluyorum. Bana yardım edebilir misin? Fortran 90 kolayca Ayrıntılı olarak

int*4 n_particles, n_groups 
real*4 group_id(n_particles) 
read (*) n_particles, n_groups 
read (*) (group_id(j),j=1,n_particles) 

tarafından okunan bu dosyayı okumak gerekir, dosya biçimidir:

Bytes 1-4 -- The integer 8. 
Bytes 5-8 -- The number of particles, N. 
Bytes 9-12 -- The number of groups. 
Bytes 13-16 -- The integer 8. 
Bytes 17-20 -- The integer 4*N. 
Next many bytes -- The group ID numbers for all the particles. 
Last 4 bytes -- The integer 4*N. 

nasıl Python ile bunu okuyabilir? Her şeyi denedim ama hiç işe yaramadı. Python'da bir f90 programını kullanabileceğim, bu ikili dosyayı okuyabildiğim ve kullanmam gereken verileri kaydettiğim ihtimal var mı?

Answer 1

Oku böyle ikili dosya içeriği:

with open(fileName, mode='rb') as file: # b is important -> binary 
    fileContent = file.read() 

sonra struct.unpack kullanarak ikili veri "açmak":

başlangıç ​​bayt: struct.unpack("iiiii", fileContent[:20])

gövdesi: başlık bayt görmezden gelip takip eden bayt (= 24); Kalan kısım bedeni oluşturur, vücuttaki bayt sayısını bilmek için 4 ile bir tamsayı bölüştürür; Elde edilen bölüm açmak yöntemi için doğru biçimi oluşturmak için dize 'i' ile çarpılır:

struct.unpack("i" * ((len(fileContent) -24) // 4), fileContent[20:-4]) 

uç bayt: struct.unpack("i", fileContent[-4:])

Answer 2

Genel olarak, bunun için Python'un struct modülünü kullanmayı tavsiye ederim. Python ile standarttır ve sorunuzun belirtimini struct.unpack() için uygun bir biçimlendirme dizesine çevirmek kolay olmalıdır.

Alanlar arasında/çevresinde "görünmez" dolgu varsa, bunu anlamanız venumaralı çağrıya eklemeniz gerektiğini veya yanlış bitleri okuyacağınızı unutmayın.

import struct 

data = open("from_fortran.bin", "rb").read() 

(eight, N) = struct.unpack("@II", data) 

Bu da dosya (hayır dolgu ya da gereksiz başında başlayacak varsayarak ilk iki alan açar: açmak için bir şey olması için dosyanın içeriğini okuma

hayli abes veri) ve ayrıca yerel bayt sırasını (@ sembolü) varsayar. Biçimlendirme dizesindeki I s "işaretsiz tam sayı, 32 bit" anlamına gelir.

Answer 3

Hem metin hem de ikili dosyalardaki verileri okuyabilen numpy.fromfile kullanabilirsiniz. İlk olarak, dosya biçiminizi temsil eden bir veri türünü numpy.dtype kullanarak oluşturup numpy.fromfile kullanarak bu tür dosyaları dosyadan okuyabilirsiniz.

Answer 4

import pickle 
f=open("filename.dat","rb") 
try: 
    while True: 
     x=pickle.load(f) 
     print x 
except EOFError: 
    pass 
f.close()